EVE游戏背景设定在遥远的未来，人类在耗尽地球资源后，便开始殖民银河系，资源的掠夺导致战争爆发。在未来的世界，人类通过各种新科技发掘更多可以生存的星球，于是到7987年，人类发现一个天然的虫洞，它将两个银河系链接起来，EVE世界的许多人便通过此虫洞移民至另一个银河系，并将它称为新伊甸。美丽的新星球逐渐被人类掌控，这里就是舰长们宇宙航行休憩的港湾。
但是人类的畅想还未结束，灾难就已到来。星门终于不堪重负，崩溃了。生死攸关的时刻，还在远航执行任务的舰长却遭遇了克隆人系统故障。如果不能成功克隆，他的本体也将消亡。他，会如何选择呢？故事又将怎样进行下去呢？
